巴楚，是巴尔楚克的简称。《西域图志》作巴尔楚克，《西陲要略》作巴里楚克。据《西域同文志》释：“巴尔楚克，全有也。地饶水草，故名。”维吾尔语称作玛热勒巴什，旧有玛喇巴什、毛拉巴什等不同译名，意为鹿首。
　
　  汉为西域尉头国地，三国、北魏时属龟兹，隋时属疏勒。唐代为安西都护府下属的尉头州。元代属别失八里行尚书省，明代属东察合台汗国，后属准噶尔。
　
　  清乾隆二十六年（1761年）设叶尔羌办事大臣，巴楚归叶尔羌管辖，是阿克苏与叶尔羌、喀什噶尔间的军事、交通重镇。清光绪三年冬（1877年）清军刘锦棠率部平定阿古柏之乱，驻扎在巴尔楚克。乾隆年间设军台，称巴尔楚克台，为叶尔羌到阿克苏十六军台之一。道光十二年（1832年）筑玛拉巴什城。清光绪九年（1883年）置玛喇巴什直隶厅，属喀什噶尔道。光绪二十九年（1903年）直隶厅改设为州，称巴楚州，隶莎车府，下辖八大庄。1913年改设巴楚县，属喀什噶尔道，1929年属喀什行政区。1943年属喀什督察专区。1949年后，先后属喀什专区、南疆行政区。1956年复改喀什专区，1978年后属喀什地区。
　
　  1999年，巴楚县辖4镇、8乡：巴楚镇、阿瓦提镇、色力布亚镇、三岔口镇、英吾斯塘乡、琼库尔恰克乡、阿克萨克马热勒乡、夏马勒乡、多来提巴格乡、阿拉格尔乡、阿纳库勒乡、恰尔巴格乡。年末总人口242166人，其中少数民族228824人，农村人口191325人。
　
　  2000年，巴楚县辖4个镇、8个乡。 根据第五次人口普查数据：全县总人口375883人，其中各乡镇人口（人）： 巴楚镇 33622 色力布亚镇 32052 阿瓦提镇 19003 三岔口镇 1113 恰尔巴格乡 21531 多来提巴格乡 23403 阿纳库勒乡 17425 夏马勒乡 8280 阿克萨克马热勒乡 23561 阿拉格尔乡 22922 琼库尔恰克乡 32109 英吾斯塘乡 19922 喀拉拜勒虚拟镇 9498 永安坝虚拟镇 946 夏和林场虚拟乡 131 克拉克勤劳改农场虚拟乡 2508 兵团44团虚拟乡 8197 兵团48团虚拟乡 7293 兵团49团虚拟乡 11463 兵团50团虚拟乡 16296 兵团51团虚拟乡 32445 兵团52团虚拟乡 14219 兵团53团虚拟乡 17944
　
　

     巴楚县是南疆重要的交通要道，南疆铁路、国道314、215线贯穿县境，构成了巴楚县优越的陆路交通优势。巴楚县土地资源、光热资源、水土资源极为丰富，驰名中外的野生植物有罗布麻、甘草、素有“沙漠人参”之称的巴楚蘑菇。县城供排水、农村、城市自来水改造，道路建设、居民小区落成等项目的相继使用，使巴楚县的农业生产、城乡贸易水电等基础设施配套，呈现协调发展的良好势头。
　
　  全县有胡杨林5万公顷，是世界罕见的大面积胡杨林生长区。驰名中外的野生植物主要有罗布麻、甘草、巴楚蘑菇等。矿产资源主要有石油天然气、岩盐等。旅游资源有托库孜色来古城遗址，夏河原始胡杨林，红海子烤鱼，刀郎歌舞等。